Per digestione anaerobica si intende il processo di degradazione e stabilizzazione biologica della sostanza organica indotto dall'attività microbica anaerobica e condotto all'interno dei digestori. Nei digestori viene emulato il processo naturale di fermentazione enterica delle vacche.​

In agricoltura la digestione anaerobica è divenuta indispensabile per la produzione sia di energia rinnovabile on-site (biogas e biometano) che di materia organica naturale (digestato). La filiera della digestione anaerobica è tecnologicamente matura, corta e in gradi di ridurre le emissioni di gas serra e di ammoniaca, di chiudere il ciclo biologico naturale dell'azienda attraverso la valorizzazione dei reflui zootecnici, sottoprodotti, scarti di lavorazione e residui vegetali; e di ridurre l'impiego dei fertilizzanti di sintesi chimica.​