Il funzionamento della Rete è garantito dall'Unità nazionale di animazione e coordinamento (UNAC) che, nell'architettura, riflette il modello delle strutture della Rete rurale europea.
L'UNAC è, inoltre, affiancata, per lo svolgimento della sua attività, da sei Unità Operative (UO).
Sono inoltre attive cinque Task force (TF) e dieci Gruppi di lavoro (GL).
La gestione delle attività di rete è affidata a tre specifiche strutture:
L'UGC, istituita nell'ambito del Mipaaf, con funzioni di coordinamento delle azioni legate alla realizzazione del Programma, opera in stretta sinergia con la Rete Rurale Europea, le reti nazionali degli altri Stati membri e gli altri partner internazionali.
L'Unità nazionale di Animazione e Coordinamento (UNAC) ha la seguente composizione:
Direttore generale della competitività per lo sviluppo rurale, con funzioni di presidente.
Dirigente dell'ufficio COSVIR II, con funzioni di vice-presidente.
Dirigente in rappresentanza della COSVIR I.
Dirigente in rappresentanza della COSVIR III.
Dirigente in rappresentanza della COSVIR V.
Dirigente in rappresentanza della COSVIR VI.
Dirigente in rappresentanza della COSVIR VIII.
Rappresentante INEA.
Rappresentante ISMEA.
Rappresentante SIN.
Le Postazioni Regionali della Rete (PRR) costituiscono il livello regionale della struttura organizzativa della Rete. Operano sotto la responsabilità diretta e il coordinamento dell'UNAC e hanno il compito di garantire l'animazione a livello regionale delle attività previste dal Piano di Azione.
La Cabina di Regia della RRN svolge la funzione operativa e gestionale di indirizzo e coordinamento delle attività previste dal Piano di Azione. E' presieduta dal Dott. Giuseppe Blasi, Direttore Generale dello Sviluppo Rurale, delle Infrastrutture e dei Servizi ed ha la seguente composizione: